Yazar "Yıldırım, Süleyman" için listeleme
-
Aksolot kol rejenerasyonunda fungus ve bakteri profillerinin boylamsal değişimlerinin incelenmesi
Altın, Kevser Hanne (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2019)Amfibiler sınıfında bulunan omurgalılar rejenerasyon mekanizmasına sahiptirler. Fakat amfibilerden urodole grubunda semender ailesinde yer alan aksolotlar, amfibi sınıfında ki diğer omurgalı canlılar arasında yüksek ... -
Alzheimer hastalığında davranışsal semptomlar ve mikrobiyota ilişkisi
Ercan, Fatma Betül (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2018)Alzheimer bellekteki yıkımla seyreden bir demans türüdür. En önemli semptom kognitif yıkım olmakla birlikte hastalıkla artan davranış bozuklukları bakım verenler için daha yorucu bir hale gelebilmektedir. Bu nedenle, ... -
Association of Enteric Protist Blastocystis spp. and gut microbiota with hepatic encephalopathy
Yıldız, Sedat; Doğan, İbrahim; Doğruman Al, Funda; Nalbantoğlu, Ufuk; Üstek, Duran; Sarzhanov, Fakhriddin; Yıldırım, Süleyman (Medical Univ Press, 2016)Background & Aims: Hepatic encephalopathy (HE) is a serious neuropsychiatric sequela emerging in the advanced stages of cirrhosis. The gut microbiota plays an important role in the development of HE. The aim of the study ... -
Axillary microbiota is associated with cognitive impairment in parkinson's disease patients
Arıkan, Muzaffer; Yıldız, Zeynep; Kahraman Demir, Tuğçe; Helvacı Yılmaz, Nesrin; Şen, Aysu; Hanoğlu, Lütfü; Yıldırım, Süleyman (American Society for Microbiology, 2022)Cognitive impairment (CI) is among the most common non-motor symptoms of Parkinson's disease (PD), with a substantially negative impact on patient management and outcome. The development and progression of CI exhibits high ... -
Deep learning-based blind image super-resolution with iterative kernel reconstruction and noise estimation
Ateş, Hasan Fehmi; Yıldırım, Süleyman; Güntürk, Bahadır Kürşat (Academic Press Inc., 2023)Blind single image super-resolution (SISR) is a challenging task in image processing due to the ill-posed nature of the inverse problem. Complex degradations present in real life images make it difficult to solve this ... -
Differentiation of claustrum resting-state functional connectivity in healthy aging, Alzheimer's disease, and Parkinson's disease
Ayyıldız, Sevilay; Velioğlu, Halil Aziz; Ayyıldız, Behçet; Sütçübaşı, Bernis; Hanoğlu, Lütfü; Bayraktaroğlu, Zübeyir; Yıldırım, Süleyman; Atasever, Alper; Yuluğ, Burak (Wiley, 2023)The claustrum is a sheet-like of telencephalic gray matter structure whose function is poorly understood. The claustrum is considered a multimodal computing network due to its reciprocal connections with almost all cortical ... -
Evaluation of parameters for high efficiency transformation of acinetobacter baumannii
Yıldırım, Süleyman; Thompson, Mitchell; Jacobs, Anna; Zurawski, Daniel; Kirkup, Benjamin (Nature Publishing Group, 2016)Acinetobacter baumannii is an emerging, nosocomial pathogen that is poorly characterized due to a paucity of genetic tools and methods. While whole genome sequence data from several epidemic and environmental strains have ... -
Experimentally induced metamorphosis in highly regenerative axolotl (ambystoma mexicanum) under constant diet restructures microbiota
Demircan, Turan; Ovezmyradov, Guvanch; Yıldırım, Berna; Keskin, İlknur; İlhan, Ayşe Elif; Fesçioğlu, Ece Cana; Öztürk, Gürkan; Yıldırım, Süleyman (Nature Publishing Group, 2018)Axolotl (Ambystoma mexicanum) is a critically endangered salamander species and a model organism for regenerative and developmental biology. Despite life-long neoteny in nature and in captive-bred colonies, metamorphosis ... -
Functional neural networks stratify Parkinson's disease patients across the spectrum of cognitive impairment
Hajebrahimi, Farzin; Budak, Miray; Sarıcaoğlu, Mevhibe; Temel, Zeynep; Kahraman Demir, Tuğçe; Hanoğlu, Lütfü; Yıldırım, Süleyman; Bayraktaroğlu, Zübeyir (Wiley, 2024)Introduction Cognitive impairment (CI) is a significant non-motor symptoms in Parkinson's disease (PD) that often precedes the emergence of motor symptoms by several years. Patients with PD hypothetically progress from ... -
Investigation of obesity-related HAdV-36 in NAFLD patients: A case-control study
Dinç, Harika Öykü; Çizmecigil, Utku; Sulu, Cem; Yıldırım, Süleyman; Turgut, Başar C.; Sirekbasan, Serhat; Aydoğan, Okan; Durman, Tunahan; Özbey, Doğukan; Aslan, Beyza; Sonsuz, Abdullah; Zengin, Kağan; Yumuk, Volkan Demirhan; Yılmaz, Aysun; Turan, Nuri; Yılmaz, Hüseyin; Tufan Koçak, Banu; Sarıbaş, Suat; Ergin, Sevgi; Kocazeybek, Bekir (Verlag Klinisches Labor GmbH, 2023)Background: HAdV-36 leads to adipocyte proliferation of adipose tissue through E4orf1 gene, leading to the development of obesity and related diseases. We aimed to investigate the presence and any association of HAdV-36 ... -
Iterative kernel reconstruction for deep learning-based blind image super-resolution
Yıldırım, Süleyman; Ateş, Hasan Fehmi; Güntürk, Bahadır Kürşat (IEEE Computer Society, 2022)Deep learning based methods have received a great deal of interest in recent years to solve the single image superresolution (SISR) problem and their performance is proven to be superior when compared to classical SR ... -
Lentiviral mertk üretimi, çoğaltılması ve iletimi
Öztürk Demir, Aslı Güner (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2018)Gen tedavisi; hastalığın gelişmesinden sorumlu olan kalıtsal ya da sonradan kazanılan genetik bozuklukların düzeltilmesi amacıyla hücrelere faydalı genler ve kısa oligonükleotid dizilerinin aktarımı olarak tanımlanır. Gen ... -
Longitudinal 16S rRNA data derived from limb regenerative tissue samples of axolotl ambystoma mexicanum
Demircan, Turan; İlhan, Ayşe Elif; Ovezmyradov, Guvanch; Öztürk, Gürkan; Yıldırım, Süleyman (Nature Publishing Group, 2019)The Mexican axolotl (Ambystoma mexicanum) is a critically endangered species and a fruitful amphibian model for regenerative biology. Despite growing body of research on the cellular and molecular biology of axolotl limb ... -
Metabolik sendrom tedavisinde bağırsak mikrobiyotasının probiyotikler ve özellikle saccharomyces boulardii ile modülasyonunun değerlendirilmesi
Boyacı, İhsan; Yıldırım, Süleyman (Hayat Sağlık ve Sosyal Hizmetler Vakfı, 2017)Metabolik sendrom insan metabolizmasındaki dengenin bozulduğu hastalıklar kümesinin adıdır. Glukoz intoleransı veya diabetes mellitus, abdominal obezite, dislipidemi, hipertansiyon ve kardiyovasküler anormallikleri barındırır. ... -
Metaproteogenomic analysis of saliva samples from Parkinson's disease patients with cognitive impairment
Arıkan, Muzaffer; Kahraman Demir, Tuğçe; Yıldız, Zeynep; Nalbantoğlu, Özkan Ufuk; Korkmaz, Nur Damla; Helvacı Yılmaz, Nesrin; Şen, Aysu; Özcan, Mutlu; Muth, Thilo; Hanoğlu, Lütfü; Yıldırım, Süleyman (Nature Portfolio, 2023)Cognitive impairment (CI) is very common in patients with Parkinson's Disease (PD) and progressively develops on a spectrum from mild cognitive impairment (PD-MCI) to full dementia (PDD). Identification of PD patients at ... -
Metaproteomic analysis of saliva samples from parkinson's disease patients with cognitive impairments
Kurbeh, Balkis (İstanbul Medipol Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2022)Parkinson's Disease (PD) is a NeuroDegenerative Disease (NDD) that includes impairment and death of dopaminergic neurons at the brain and alpha-synuclein (α-syn) protein accumulation (Lewy bodies). PD symptoms include both ... -
Microbiome and longevity: High abundance of longevity-linked muribaculaceae in the gut of the long-living rodentspalax leucodon
Sibai, Mustafa; Altuntaş, Ebru; Yıldırım, Berna; Öztürk, Gürkan; Yıldırım, Süleyman; Demircan, Turan (Mary Ann Liebert Inc, 2020)With a world population living longer as well as marked disparities in life expectancy, understanding the determinants of longevity is one of the priority research agendas in 21st century life sciences. To this end, the ... -
Parkinson hastalığı demansı ile bağırsak mikrobiyotasındaki akkermansia genomik çeşitliliği arasındaki ilişkinin incelenmesi
Arıkan, Muzaffer; Kahraman Demir, Tuğçe; Yıldız, Zeynep; Helvacı Yılmaz, Nesrin; Şen, Aysu; Hanoğlu, Lütfü; Yıldırım, Süleyman (Ankara Mikrobiyoloji Derneği, 2024)Parkinson hastalığında (PH), genellikle sağlıkla ilişkilendirilen bir bakteri cinsi olan Akkermansia’nın bağırsak mikrobiyotasında artış gösterdiği bilinse de bu artışın nedeni tam olarak anlaşılamamıştır. Bu çalışmada ... -
Primate vaginal microbiomes exhibit species specificity without universal Lactobacillus dominance
Yıldırım, Süleyman; Yeoman, Carl J.; Janga, Chandra Sarath; Thomas, Susan M.; Ho, Mengfei; Leigh, Steven R.; Consortium, Primate Microbiome; White, Bryan A.; Wilson, Brenda A.; Stumpf, Rebecca M . (Nature Publishing Group, 2014)Bacterial communities colonizing the reproductive tracts of primates (including humans) impact the health, survival and fitness of the host, and thereby the evolution of the host species. Despite their importance, we ... -
Ramazan orucunun prediyabet hastalarının metabolik parametreleri ve mikrobiyota değişimleri üzerine etkisi
Koç, Fatma (İstanbul Medipol Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2018)Diyabet, prevalansı gün geçtikçe artan metabolik bir hastalıktır. Genellikle insülin direncine bağlı olarak gelişmektedir. Son yıllarda metagenomik araştırmaların gelişmesiyle mikrobiyota analizleri yaygınlaşmıştır. Yapılan ...